Navýšení spolehlivosti celostátního genomického hodnocení dojeného skotu zařazením krav s domácí užitkovostí do genotypované referenční populace Číslo projektu QK1810253
Kategorie projektu PROJEKTY NAZV / National Agency for Agricultural Research PROJECTS
Poskytovatel projektu MZE ČR Popis projektu Zvýšení spolehlivosti systému celostátního hodnocení dojeného skotu zvětšením referenční populace SNP genotypováním krav s domácí užitkovostí. S tím souvisí ekonomická optimalizace techniky odběrů zdrojů DNA v chovech pro čipové a NGS technologie v servisní laboratoři, úprava a imputace vstupních údajů z čipů na jednotný formát umožňující porovnání jedinců a ověřování původu v propojení s testy statusu genů s vlivem na zdraví a užitkovost (dosud testováno odděleně STR technologií). Návazně bude populační studie na úrovni jednotlivých SNP a stanovení genetických rozdílů na úrovni DNA mezi domácí populací krav a populací dovážených zahraničních plemeníků (tvorba skupin do BLUP). Konečným cílem je algoritmus stanovení genomické plemenné hodnoty (GEPH) s využitím všech genotypovaných jedinců.
Období 2018 - 2022 Odkaz do ISVAV https://www.rvvi.cz/cep?s=jednoduche-vyhledavani&ss=detail&n=0&h=QK1810253
Název Rok KRANJČEVIČOVÁ, Anita, KAŠNÁ, Eva, VOSTRÝ, Luboš a BRZÁKOVÁ, Michaela., 2020 Comparison of imputation methods in Czech Holstein population. In Book of Abstracts of the 71st Annual Meeting of the European Federation of Animal Science . Wageningen: Wageningen Academic, s. 380. ISSN 2020 KAŠNÁ, Eva, ZAVADILOVÁ, Ludmila, KRUPA, Emil, KRUPOVÁ, Zuzana a KRANJČEVIČOVÁ, Anita. Evaluation of gestation length in Czech Holstein cattle. Czech Journal of Animal Science , 2020, 65 , 473-481. ISSN 1212-1819. 2020 VÝZKUMNÝ ÚSTAV ŽIVOČIŠNÉ VÝROBY, v.v.i. V UHŘÍNĚVSI. PxSNP v1.0. Autoři: KLÍMOVÁ, Anita a KLÍMA, Jakub.. Česká republika. Software PxSNP. 2020-11-10. 2020 KLÍMOVÁ, Anita, KAŠNÁ, Eva, MACHOVÁ, Karolína, BRZÁKOVÁ, Michaela, PŘIBYL, Josef a VOSTRÝ, Luboš. The use of genomic data and imputation methods in dairy cattle breeding. Czech Journal of Animal Science , 2020, 65 , 445-453. ISSN 1212-1819. 2020 NOSKOVÁ, A., PŘIBYL, Josef a KAŠNÁ, Eva. Dlouhověkost dojnic v závislosti na jejich zevnějšku. Náš chov , 2019, roč. 79 (9), s. 41-42. ISSN . 2019 HOFMANNOVÁ, Michala, PŘIBYL, Josef, KRUPA, Emil a PEŠEK, Petr. Estimation of inbreeding effect on conception in Czech Holstein. Czech Journal of Animal Science , 2019, 64 , 309-316. ISSN 1212-1819. 2019 KRANJČEVIČOVÁ, Anita, VOSTRÝ, Luboš, KAŠNÁ, Eva, PŘIBYL, Josef a BRZÁKOVÁ, Michaela., 2019 Factors affecting accuracy of population imputation in dairy cattle. In ASD 2019 – Book of Abstracts . Prague: Czech University of Life Sciences Prague, s. n.. ISSN 2019 ZAVADILOVÁ, Ludmila, KAŠNÁ, Eva a KRUPOVÁ, Zuzana., 2019 Genomic breeding values for claw diseases/disorders in Czech Holstein cows. In ASD 2019 – Book of Abstracts . : , s. n.. ISSN 2019 ZAVADILOVÁ, Ludmila, KAŠNÁ, Eva a KRUPOVÁ, Zuzana. Genomic breeding values for claw diseases/disorders in Czech Holstein cows. Acta Universitatis Agriculturae et Silviculturae Mendelianae Brunensis , 2019, 67 , 1245-1251. ISSN 1211-8516. 2019 KRANJČEVIČOVÁ, Anita, KAŠNÁ, Eva, BRZÁKOVÁ, Michaela, PŘIBYL, Josef a VOSTRÝ, Luboš. Impact of reference population and marker density on accuracy of population imputation. Czech Journal of Animal Science , 2019, 64 , 405-410. ISSN 1212-1819. 2019 KAŠNÁ, Eva., 2019 Improvement of dairy cattle genomic evaluation in the Czech Republic. In Prezentace na semináři 29.11.2019 . Guelph (Kanada): Universita Guelph, s. . ISSN 2019 PŘIBYL, Josef. Odhad genetických parametrů pro plemeno holštýn metodou RR TDM - BLUP. Praha Uhříněves: Výzkumný ústasv živočišné výroby v.v.i., 2019, 58 s. ISBN 2019 NOSKOVÁ, Adéla, přibyl, Josef a VOSTRÝ, Luboš., 2019 Relationship between conformation traits and milk yield, lifetime production and number of lactations in Czech Holstein cows. In New traits and adding value to the recording and ID services in the animal production. Proceedings of the 43rd ICAR conference held in Prague (CZ) on 17-21 June 2019. ICAR Technical Series no. 24. . Prague: ICAR, Via Savoia 78, 00198 Rome, Italy, s. . ISSN 92-95014-20-0 2019 ZAVADILOVÁ, Ludmila, KAŠNÁ, Eva a KRUPOVÁ, Zuzana. Šlechtění na zvýšení odolnosti vůči klinické mastitidě u holštýnského skotu. Náš chov , 2019, roč. 79 (9), s. 25-29. ISSN 0027-8068. 2019 NOSKOVÁ, A., PŘIBYL, Josef a KAŠNÁ, Eva., 2018 Analysis of Relationship Between Conformation and Production Traits at the Level of Measured (phenotypic) Values. In XXVIIIth Genetic Days 2018 . České Budějovice: University of South Bohemia, s. 63-64. ISSN 2018 PŘIBYLOVÁ, Jana, BAUER, Jiří, MOTYČKA, J., PŘIBYL, Josef, ŠPLÍCHAL, J., VOSTRÁ VYDROVÁ, Hana a VOSTRÝ, Luboš., 2018 Genetic Differences of Groups of Animals in Genomic Evaluation of Dairy Cattle. In XXVIIIth Genetic Days 2018 . České Budějovice: University of South Bohemia, s. 67. ISSN 2018 ŽÁKOVÁ, Eliška, KRUPA, Emil, PŘIBYL, Josef a KRUPOVÁ, Zuzana., 2018 Genetic Groups of Dam Lines in the Czech Pig Breeding Values Prediction. In XXVIIIth Genetic Days 2018 . České Budějovice: University of South Bohemia, s. 70-71. ISSN 2018 PŘIBYL, Josef, BAUER, Jiří, MOTYČKA, J., PŘIBYLOVÁ, Jana, ŠPLÍCHAL, J., VOSTRÁ VYDROVÁ, Hana a VOSTRÝ, Luboš., 2018 Step of Agreement of Pedigree and Genomic Relationship in Genomic Evaluation of Dairy Cattle. In XXVIIIth Genetic Days 2018 . : , s. 25. ISSN 2018
VŠECHNY PUBLIKACE
VÚŽV v.v.i. >
Projekty
