Navýšení spolehlivosti celostátního genomického hodnocení dojeného skotu zařazením krav s domácí užitkovostí do genotypované referenční populace

Číslo projektu QK1810253
Kategorie projektu PROJEKTY NAZV / National Agency for Agricultural Research PROJECTS
Hlavní řešitel za ústav Kašná Eva, Ing., Ph.D.
Poskytovatel projektuMZE ČR
Popis projektu

Zvýšení spolehlivosti systému celostátního hodnocení dojeného skotu zvětšením referenční populace SNP genotypováním krav s domácí užitkovostí. S tím souvisí ekonomická optimalizace techniky odběrů zdrojů DNA v chovech pro čipové a NGS technologie v servisní laboratoři, úprava a imputace vstupních údajů z čipů na jednotný formát umožňující porovnání jedinců a ověřování původu v propojení s testy statusu genů s vlivem na zdraví a užitkovost (dosud testováno odděleně STR technologií). Návazně bude populační studie na úrovni jednotlivých SNP a stanovení genetických rozdílů na úrovni DNA mezi domácí populací krav a populací dovážených zahraničních plemeníků (tvorba skupin do BLUP). Konečným cílem je algoritmus stanovení genomické plemenné hodnoty (GEPH) s využitím všech genotypovaných jedinců.

Období2018 - 2022
Odkaz do ISVAVhttps://www.rvvi.cz/cep?s=jednoduche-vyhledavani&ss=detail&n=0&h=QK1810253
Odkaz na projekt
Interní odkaz

NázevRok
VOSTRÝ, Luboš, VOSTRÁ VYDROVÁ, Hana, MORAVČÍKOVÁ, Nina, KASARDA, Radovan, CUBRIC-CURIK, Vatka, BRZÁKOVÁ, Michaela et al. Genomic diversity and population structure of the Czech Holstein cattle. Livestock Science, 2023, 273, Article number: 105261. ISSN 1871-1413. 2023
ZAVADILOVÁ, Ludmila, KAŠNÁ, Eva, KRUPOVÁ, Zuzana a VOSTRÝ, Luboš. Mixed reference population in genomic evaluation for clinical mastitis in Czech Holstein cattle. Acta Fytotechnica et Zootechnica, 2023, roč. 26(1), s. 46-54. ISSN 1336-9245. 2023
KAŠNÁ, Eva, ZAVADILOVÁ, Ludmila a KRUPOVÁ, Zuzana., 2022 Genetic evaluation of cystic ovarian disease in Czech Holstein cattle. In World Congress on genetics Applied to Livestock Production, Rotterdam, The Netherlands. 3 - 8 July 2022. Rotterdam: WCGALP, s. n. ISSN 2022
ZAVADILOVÁ, Ludmila, KAŠNÁ, Eva, KUČERA, J. a BAUER, J., 2022 Genomic Evaluation for Clinical mastitis in Czech Holstein. In INTERBULL BULLETIN NO. 57.. Montreal, Canada: ICAR, s. 89-94. ISSN 2022
KAŠNÁ Eva, ZAVADILOVÁ, Ludmila, KUČERA, J. a ŠPLÍCHAL, J., 2022 Genomic evaluation of reproductive disorders in Czech Holstein cattle. In INTERBULL BULLETIN NO. 57.. Montreal, Canada: ICAR, s. 42-47. ISSN 1011-6079 2022
ZAVADILOVÁ, Ludmila, KAŠNÁ, Eva a KLÍMOVÁ, Anita., 2022 Genomické plemenné hodnoty pro klinickou mastitidu u holštýnského skotu, zdvojené genotypy v genomické referenční populaci. In Příspěvek J. G. Mendela ke šlechtění hospodářských zvířat. Praha Uhříněves: Výzkumný ústav živočišné výroby, v. v. i. Praha Uhříněves Oddělení genetiky a šlechtění hospodářských zvířat, s. 57-65. ISSN 2022
VÝZKUMNÝ ÚSTAV ŽIVOČIŠNÉ VÝROBY, v.v.i. V UHŘÍNĚVSI. Odhad genomických plemenných hodnot pro odolnost vůči vzniku ovariálních cyst se zahrnutím krav s domácím fenotypem do referenční populace. Autoři: KAŠNÁ, Eva, ZAVADILOVÁ, Ludmila a KRUPOVÁ, Zuzana.. Česká republika. Certifikovaná metodika 978-80-7403-280-6. 2022-11-30. 2022
VOSTRÁ VYDROVÁ, Hana, BRZÁKOVÁ, Michaela, MORAVČÍKOVÁ, Nina, KASARDA, Radovan, FULÍNOVÁ, Daniela, HOFMANOVÁ, Barbora a VOSTRÝ, Luboš., 2022 Vliv inbrední deprese na mléčnou užitkovost u skotu. In Příspěvek J. G. Mendela ke šlechtění hospodářských zvířat. Praha Uhříněves: Výzkumný ústav živočišné výroby, v. v. i. Praha Uhříněves Oddělení genetiky a šlechtění hospodářských zvířat, s. 45-48. ISSN 2022
KRUPOVÁ, Zuzana, WOLFOVÁ, Marie, KRUPA, Emil, KAŠNÁ, Eva a ZAVADILOVÁ, Ludmila., 2021 Economic value of milkability in Czech Holstein. In Book of Abstracts of the 72nd Annual Meeting of the European Federation of Animal Science. Wageningen, The Netherlands: Wageningen Academic Publishers, s. 594. ISSN 2021
ZAVADILOVÁ, Ludmila, KAŠNÁ, Eva, KLÍMOVÁ, Anita a KRUPOVÁ, Zuzana., 2021 Genomic Breeding Values for Clinical Mastitis in Czech Holstein Cattle. In 29th Animal Science Days International Symposium. Gödöllö - Hungary: Hungarian University of Agriculture and Life Sciences, s. 18. ISSN 2021
KAŠNÁ, Eva, ZAVADILOVÁ, Ludmila. KLÍMOVÁ, Anita a KRUPOVÁ, Zuzana., 2021 Genomic evaluation of gestation length in Holstein cattle. In 29th Animal Science Days International Symposium. Gödöllö - Hungary: Hungarian University of Agriculture and Life Sciences, s. 12. ISSN 2021
VÝZKUMNÝ ÚSTAV ŽIVOČIŠNÉ VÝROBY, v.v.i. V UHŘÍNĚVSI. Odhad genomických plemenných hodnot pro délku březosti u holštýnského skotu. Autoři: KAŠNÁ, Eva, ZAVADILOVÁ, Ludmila, KLÍMOVÁ, Anita a KRUPOVÁ, Zuzana.. Česká republika. Certifikovaná metodika 978-80-7403-255-4. 2021-11-15. 2021
ZAVADILOVÁ, Ludmila, KAŠNÁ, Eva a KLÍMOVÁ, Anita., 2021 Spolehlivost genomických plemenných hodnot pro znaky zdraví u holštýnských dojnic. In Aktuální směry ve šlechtění hospodářských zvířat. Praha Uhříněves: Výzkumný ústav živočišné výroby v.v.i., s. 29-38. ISSN 2021
KRUPOVÁ, Zuzana, PŘIBYL, Josef, KRUPA, Emil, KAŠNÁ, Eva, ZAVADILOVÁ, Ludmila a MOTYČKA, J. Šlechtění na efektivnost krmiv u Holštýna. Černostrakaté novinky, 2021, roč. 2021(1), s. 12-13. ISSN . 2021
ZAVADILOVÁ, Ludmila, KAŠNÁ, Eva a KRUPOVÁ, Zuzana. Využití genomické selekce při šlechtění holštýnských dojnic na odolnost vůči nemocem paznehtů. Černostrakaté novinky, 2021, roč. 2021(1), s. 10-11. ISSN . 2021
KRANJČEVIČOVÁ, Anita, KAŠNÁ, Eva, VOSTRÝ, Luboš a BRZÁKOVÁ, Michaela., 2020 Comparison of imputation methods in Czech Holstein population. In Book of Abstracts of the 71st Annual Meeting of the European Federation of Animal Science. Wageningen: Wageningen Academic, s. 380. ISSN 2020
KAŠNÁ, Eva, ZAVADILOVÁ, Ludmila, KRUPA, Emil, KRUPOVÁ, Zuzana a KRANJČEVIČOVÁ, Anita. Evaluation of gestation length in Czech Holstein cattle. Czech Journal of Animal Science, 2020, 65, 473-481. ISSN 1212-1819. 2020
VÝZKUMNÝ ÚSTAV ŽIVOČIŠNÉ VÝROBY, v.v.i. V UHŘÍNĚVSI. PxSNP v1.0. Autoři: KLÍMOVÁ, Anita a KLÍMA, Jakub.. Česká republika. Software PxSNP. 2020-11-10. 2020
KLÍMOVÁ, Anita, KAŠNÁ, Eva, MACHOVÁ, Karolína, BRZÁKOVÁ, Michaela, PŘIBYL, Josef a VOSTRÝ, Luboš. The use of genomic data and imputation methods in dairy cattle breeding. Czech Journal of Animal Science, 2020, 65, 445-453. ISSN 1212-1819. 2020
NOSKOVÁ, A., PŘIBYL, Josef a KAŠNÁ, Eva. Dlouhověkost dojnic v závislosti na jejich zevnějšku. Náš chov, 2019, roč. 79(9), s. 41-42. ISSN . 2019
HOFMANNOVÁ, Michala, PŘIBYL, Josef, KRUPA, Emil a PEŠEK, Petr. Estimation of inbreeding effect on conception in Czech Holstein. Czech Journal of Animal Science, 2019, 64, 309-316. ISSN 1212-1819. 2019
KRANJČEVIČOVÁ, Anita, VOSTRÝ, Luboš, KAŠNÁ, Eva, PŘIBYL, Josef a BRZÁKOVÁ, Michaela., 2019 Factors affecting accuracy of population imputation in dairy cattle. In ASD 2019 – Book of Abstracts. Prague: Czech University of Life Sciences Prague, s. n.. ISSN 2019
ZAVADILOVÁ, Ludmila, KAŠNÁ, Eva a KRUPOVÁ, Zuzana., 2019 Genomic breeding values for claw diseases/disorders in Czech Holstein cows. In ASD 2019 – Book of Abstracts. : , s. n.. ISSN 2019
ZAVADILOVÁ, Ludmila, KAŠNÁ, Eva a KRUPOVÁ, Zuzana. Genomic breeding values for claw diseases/disorders in Czech Holstein cows. Acta Universitatis Agriculturae et Silviculturae Mendelianae Brunensis, 2019, 67, 1245-1251. ISSN 1211-8516. 2019
KRANJČEVIČOVÁ, Anita, KAŠNÁ, Eva, BRZÁKOVÁ, Michaela, PŘIBYL, Josef a VOSTRÝ, Luboš. Impact of reference population and marker density on accuracy of population imputation. Czech Journal of Animal Science, 2019, 64, 405-410. ISSN 1212-1819. 2019
KAŠNÁ, Eva., 2019 Improvement of dairy cattle genomic evaluation in the Czech Republic. In Prezentace na semináři 29.11.2019. Guelph (Kanada): Universita Guelph, s. . ISSN 2019
PŘIBYL, Josef. Odhad genetických parametrů pro plemeno holštýn metodou RR TDM - BLUP. Praha Uhříněves: Výzkumný ústasv živočišné výroby v.v.i., 2019, 58 s. ISBN 2019
NOSKOVÁ, Adéla, přibyl, Josef a VOSTRÝ, Luboš., 2019 Relationship between conformation traits and milk yield, lifetime production and number of lactations in Czech Holstein cows. In New traits and adding value to the recording and ID services in the animal production. Proceedings of the 43rd ICAR conference held in Prague (CZ) on 17-21 June 2019. ICAR Technical Series no. 24.. Prague: ICAR, Via Savoia 78, 00198 Rome, Italy, s. . ISSN 92-95014-20-0 2019
ZAVADILOVÁ, Ludmila, KAŠNÁ, Eva a KRUPOVÁ, Zuzana. Šlechtění na zvýšení odolnosti vůči klinické mastitidě u holštýnského skotu. Náš chov, 2019, roč. 79(9), s. 25-29. ISSN 0027-8068. 2019
NOSKOVÁ, A., PŘIBYL, Josef a KAŠNÁ, Eva., 2018 Analysis of Relationship Between Conformation and Production Traits at the Level of Measured (phenotypic) Values. In XXVIIIth Genetic Days 2018. České Budějovice: University of South Bohemia, s. 63-64. ISSN 2018
PŘIBYLOVÁ, Jana, BAUER, Jiří, MOTYČKA, J., PŘIBYL, Josef, ŠPLÍCHAL, J., VOSTRÁ VYDROVÁ, Hana a VOSTRÝ, Luboš., 2018 Genetic Differences of Groups of Animals in Genomic Evaluation of Dairy Cattle. In XXVIIIth Genetic Days 2018. České Budějovice: University of South Bohemia, s. 67. ISSN 2018
ŽÁKOVÁ, Eliška, KRUPA, Emil, PŘIBYL, Josef a KRUPOVÁ, Zuzana., 2018 Genetic Groups of Dam Lines in the Czech Pig Breeding Values Prediction. In XXVIIIth Genetic Days 2018. České Budějovice: University of South Bohemia, s. 70-71. ISSN 2018
PŘIBYL, Josef, BAUER, Jiří, MOTYČKA, J., PŘIBYLOVÁ, Jana, ŠPLÍCHAL, J., VOSTRÁ VYDROVÁ, Hana a VOSTRÝ, Luboš., 2018 Step of Agreement of Pedigree and Genomic Relationship in Genomic Evaluation of Dairy Cattle. In XXVIIIth Genetic Days 2018. : , s. 25. ISSN 2018

VŠECHNY PUBLIKACE

Na projektu se podílí někteří pracovníci oddělení:

Genetika a šlechtění hospodářských zvířat