Celostátní informační systém genetického hodnocení hospodářských zvířat

Číslo projektu QJ1510139
Kategorie projektu PROJEKTY NAZV / National Agency for Agricultural Research PROJECTS
Poskytovatel projektuMZE ČR
Popis projektu

Cílem je trvalý vývoj a průběžné uplatňování metod hodnocení plemenných zvířat v celostátním chovatelském informačním systému. Způsoby hodnocení zvířat se trvale prudce vyvíjí. Nové postupy jsou celosvětově téměř okamžitě zaváděny do provozu celostátních hodnocení zvířat. Včasné uplatnění co nejnovějších a nejpřesnějších postupů má ekonomické důsledky. Navrhovaný projekt je zaměřen na úpravu stávajících a vývoj nových matematicko-statistických postupů genetického hodnocení hospodářských zvířat, včetně genetických parametrů, vhodných pro výrobní podmínky ČR, postupů umožňujících napojení na celosvětové hodnocení (Interbull, Interbeef) a jejich uplatnění v celostátním chovatelském informačním systému.Řešení pokrývá hlavní druhy hospodářských zvířat. Cíle jsou obecné a jejich využití podle jednotlivých živočišných druhů: Vývoj algoritmů a metod řešení velkých soustav rovnic lineárních modelů se smíšenými pevnými a náhodnými efekty, váhami podle důležitosti vstupních fenotypových údajů, zohledněním vícerozměrných veličin, korelovaných maternálních efektů a kovariančních matic polynomů s náhodnými regresemi (random regression). Slučování rodokmenových a genomických informací, stanovení populačně-genetických parametrů se zahrnutím genomických údajů, včlenění mezinárodních údajů a spolehlivostí plemenných hodnot. Včlenění do celostátních informačních systémů.

Období2015 - 2018
Odkaz do ISVAVQJ1510139

Cílem je trvalý vývoj a průběžné uplatňování metod hodnocení plemenných zvířat v celostátním chovatelském informačním systému. Způsoby hodnocení zvířat se trvale prudce vyvíjí. Nové postupy jsou celosvětově téměř okamžitě zaváděny do provozu celostátních hodnocení zvířat. Včasné uplatnění co nejnovějších a nejpřesnějších postupů má ekonomické důsledky. Navrhovaný projekt je zaměřen na úpravu stávajících a vývoj nových matematicko-statistických postupů genetického hodnocení hospodářských zvířat, včetně genetických parametrů, vhodných pro výrobní podmínky ČR, postupů umožňujících napojení na celosvětové hodnocení (Interbull, Interbeef) a jejich uplatnění v celostátním chovatelském informačním systému.Řešení pokrývá hlavní druhy hospodářských zvířat. Cíle jsou obecné a jejich využití podle jednotlivých živočišných druhů: Vývoj algoritmů a metod řešení velkých soustav rovnic lineárních modelů se smíšenými pevnými a náhodnými efekty, váhami podle důležitosti vstupních fenotypových údajů, zohledněním vícerozměrných veličin, korelovaných maternálních efektů a kovariančních matic polynomů s náhodnými regresemi (random regression). Slučování rodokmenových a genomických informací, stanovení populačně-genetických parametrů se zahrnutím genomických údajů, včlenění mezinárodních údajů a spolehlivostí plemenných hodnot. Včlenění do celostátních informačních systémů.

NázevRok
NOVOTNÁ, Alexandra, SVITÁKOVÁ, Alena, VESELÁ, Zdeňka a VOSTRÝ, Luboš., 2018 Genetic parameters and breeding values for linear type traits in the Czech sport horse population. In Book of Abstracts of the 69th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science. The Netherlands: Wageningen Academic Publishers, s. 507. ISSN 2018
KRUPOVÁ, Zuzana, KRUPA, Emil a PŘIBYL, Josef. Ziskovost chovu holštýnské krávy. Černostrakaté novinky, 2018, roč. 2018(1), s. 15. ISSN . 2018
PŘIBYL, Josef, PŘIBYLOVÁ, Jana a VOSTRÝ, Luboš., 2017 Biometrical Approaches in Genetics and Breeding of Farm Animals. In XXI. Summer School of Biometrics. Brno: Mendelova univerzita, s. 15. ISSN 2017
KRUPOVÁ, Zuzana, PŘIBYL, Josef, KRUPA, Emil a WOLFOVÁ, Marie. Claw Disease Incidence as a New Trait in the Breeding Goal for the Czech Holstein Population. Agriculturae Conspectus Scientificus, 2017, 82, 235-239. ISSN 1331-7768. 2017
BRZÁKOVÁ, Michaela, SVITÁKOVÁ, Alena a VESELÁ, Zdeňka. Genetické hodnocení dlouhověkosti masného skotu. Náš chov, 2017, roč. 77(9), s. 32-33. ISSN . 2017
HOFMANNOVÁ, Michala, PŘIBYL, Josef, KRUPA, Emil a PEŠEK, Petr., 2017 Multi-Trait Evaluation of Binomial Traits in Dairy Cattle. In XXI. Summer School of Biometrics. Brno: Mendelova univerzita, s. 36. ISSN 2017
PŘIBYL, Josef, BAUER, Jiří, PŘIBYLOVÁ, Jana, ŠPLÍCHAL, Jiří, VOSTRÝ, Luboš a ZAVADILOVÁ, Ludmila, 2017 Partial Domestic Milk Test-Day-Records and Global De-Regressed Breeding Values in Common Random Regression Evaluatio. In XXI. Summer School of Biometrics. Brno: Mendelova univerzita, s. 57. ISSN 2017
KRUPOVÁ, Zuzana, PŘIBYL, Josef, KRUPA, Emil a ZAVADILOVÁ, Ludmila, 2017 Response on claw health in breeding of Czech Holstein cattle. In EAAP – 68th Annual Meeting, Tallinn 2017. Wageningen: Wageningen Academic Publishers, s. 184. ISSN 2017
HOFMANNOVÁ, Michala, PŘIBYL, Josef, KRUPA, Emil a PEŠEK, Petr. Vliv příbuzenské plemenitby na plodnost u holštýnského skotu. Náš chov, 2017, roč. 77(9), s. 18-20. ISSN 0027-8068. 2017
PŘIBYLOVÁ, Jana, BAUER, Jiří, ČERMÁK, V, FULÍNOVÁ, Daniela, MOTYČKA, Jiří, PEŠEK, Petr, PŘIBYL, Josef, ŠPLÍCHAL, Jiří, VOSTRÁ VYDROVÁ, Hana, VOSTRÝ, Luboš a ZAVADILOVÁ, Ludmila, 2016 Comparison of genomic breeding values of Holstein in the Czech Republic. In Acta fytotechnica et zootechnica, (3). Nitra: Slovak University of Agriculture, s. 79-81. ISSN 1335-258X 2016
SCHMIDOVÁ, Jitka, MILERSKI, Michal, SVITÁKOVÁ, Alena a VOSTRÝ, Luboš. Effects of service ram on litter size in Romanov sheep. Small Ruminant Research, 2016, 141, 56-62. ISSN 0921-4488. 2016
PŘIBYL, Josef, BAUER, Jiří, ČERMÁK, Václav, FULÍNOVÁ, Daniela, MOTYČKA, Jiří, PEŠEK, Petr, PŘIBYLOVÁ, Jana, ŠPLÍCHAL, Jiří, VOSTRÁ VYDROVÁ, Hana, VOSTRÝ, Luboš a ZAVADILOVÁ, Ludmila, 2016 GWAS in practical cattle breeding in the Czech Republic - single step method, genetic progress. In Acta fytotechnica et zootechnica, (3). Nitra: Slovak University of Agriculture, s. 74-78. ISSN 1335-258X 2016
KRANJČEVIČOVÁ, Anita a PŘIBYL, Josef., 2016 Imputation of missing genetic markers SNP using linear regression models. In Acta fytotechnica et zootechnica , Spec.Issue. Nitra: Slovak University of Agriculture, s. 27-30. ISSN 1335-258X 2016
VÝZKUMNÝ ÚSTAV ŽIVOČIŠNÉ VÝROBY, v.v.i. V UHŘÍNĚVSI. Metodika GEPH na základě referenčního souboru složeného z domácích TD záznamů a Interbullem přepočtených mezinárodních MACE hodnot. Autoři: PŘIBYL, Josef, BAUER, Jiří, KRANJČEVIČOVÁ, Anita, PEŠEK, Petr, PŘIBYLOVÁ, Jana, VOSTRÝ, Luboš a ZAVADILOVÁ, Ludmila. Česká republika. Certifikovaná metodika 978-80-7403-157-1. 2016-12-21. 2016
SCHMIDOVÁ, Jitka, MILERSKI, Michal, SVITÁKOVÁ, Alena, NOVOTNÁ, Alexandra, VOSTRÁ VYDROVÁ, Hana a VOSTRÝ, Luboš The Influence of Ram on Litter Size in Suffolk Sheep. Acta Agriculturae Slovenica, 2016, 2016, 109-112. ISSN 1581-9175. 2016
SCHMIDOVÁ, Jitka, MILERSKI, Michal, SVITÁKOVÁ, Alena, NOVOTNÁ, Alexandra, VOSTRÁ VYDROVÁ, Hana a VOSTRÝ, Luboš., 2016 The Influence of Ram on Litter Size in Suffolk Sheep. In Acta agriculturae Slovenica, Supplement 5. Ljubljana: Animal Science Days, s. 109-112. ISSN 1581-9175 2016
KRANJČEVIČOVÁ, Anita, BRZÁKOVÁ, Michaela, PŘIBYL, Josef, SVITÁKOVÁ, Alena a FIALOVÁ, Z. Vliv pohlaví telete na mléčnou užitkovost dojnice. Náš chov, 2016, roč. 76(10), s. 32-33. ISSN . 2016
PŘIBYL, Josef. Interbullové PH a genomické hodnocení. Zemědělský týdeník příloha Moderní živočišná výroba, 2015, roč. XVIII(25), s. 10-11. ISSN . 2015
VOSTRÝ, Luboš. Metody a postupy stanovení GEPH. Zemědělský týdeník příloha Moderní živočišná výroba, 2015, roč. XVIII(25), s. 7. ISSN . 2015
PŘIBYL, Josef. PH a plemenitba dojeného skotu. Zemědělský týdeník příloha Moderní živočišná výroba, 2015, roč. XVIII(25), s. 6. ISSN . 2015
BAUER, Jiří, PŘIBYL Josef a VOSTRÝ, Luboš. Short communication: Reliability of single-step genomic BLUP breeding values by multi-trait test-day model analysis. Journal of Dairy Science, 2015, 98, 4999-5003. ISSN 0022-0302. 2015
BAUER, Jiří. Spolehlivost PH a GEPH. Zemědělský týdeník příloha Moderní živočišná výroba, 2015, roč. XVIII(25), s. 12-13. ISSN . 2015
PŘIBYL, Josef a PŘIBYLOVÁ, Jana. Zahraniční Interbullové plemenné hodnoty v genomickém hodnocení. GenoTyp, 2015, roč. 2015(není), s. 9-10. ISSN . 2015

VŠECHNY PUBLIKACE

Na projektu se podílí někteří pracovníci oddělení:

Genetika a šlechtění hospodářských zvířat