Významnou oblastí zahraničního obchodu Polska a ČR je agrární sektor. V Polsku byla dosažena v roce 2017 kladná bilance zahraničního obchodu s agrárními produkty, zatímco v ČR agrární dovozy převyšují dlouhodobě vývozy. Z vybraných zemědělských komodit vykázalo v roce 2016 Polsko nejvyšší kladnou bilanci z exportu masa. Ve stejném roce v ČR bylo kladné bilance dosaženou pouze z obchodu s obilím a s mlékem. Hlavními příjemci polských agrárních produktů bylo Německo (24 %) a Velká Británie (9 %) a pro ČR byly v roce 2017 hlavními vývozními státy Slovensko (21,9 %) a Německo (19,2 %).