Il bacino del Fiume Merse si trova tra le province di Siena e Grosseto ed è stato interessato da un’intensa attività di estrazione mineraria nel corso degli ultimi secoli. Inquinato in seguito a questa attività mineraria dall’inizio dell’era industriale, il fiume ha recentemente goduto di una certa attenzione mediatica che ha portato ad un progetto di bonifica, conclusosi nel 2009. Stando a studi sulla qualità ambientale condotti dall’ARPAT tra il 2011 e il 2012, l’esito della bonifica sembrerebbe essere stato solo parzialmente positivo, con qualità del fiume che spazia da un ambiente con moderati segni di alterazione ad un ambiente fortemente degradato.