Významný nárůst používání antibiotik v chovech zvířat včetně jejich nezodpovědného používání (poddávkování, předepisování), nadužívání a zneužívání (např. u virových infekcí) patří mezi klíčové faktory, které urychlují vývoj antimikrobiální rezistence u původců onemocnění lidí. Spolu s managementem a biosekuritou je vakcinace nedílnou součástí prevence výskytu bakteriálních a virových infekcí, čímž současně dojde také ke snížení použití antimikrobik, a tím i předcházení nárůstu infekcí způsobených patogeny rezistentními na antimikrobika. S klesající dostupností nových antibiotik proto představuje vakcinace jeden z významných nástrojů snížení výskytu antimikrobiální rezistence.