Název oddělení	Týmy oddělení
Biologie reprodukce	Regulace zrání savčích oocytů , Embryobiotechnologie
Chov prasat	Produkční systémy chovu prasat , Reprodukce prasat , Klasifikace JUT prasat
Chov skotu	Chov dojeného skotu , Ekonomika odvětví chovu skotu
Etologie	Etologie a welfare jelenovitých a koňovitých , Etologie a welfare skotu a prasat
Fyziologie výživy a jakost produkce	Drůbež , Laboratoř mikrobiologie , Laboratoře , Výživa a experimentální chov brojlerových králíků , Výzkum s využitím laboratorních hlodavců
Genetika a šlechtění hospodářských zvířat	Biometrická jednotka , Dojený skot , Ekonomika chovu a program ECOWEIGHT , Koně , Masný skot , Molekulární genetika , Ovce a kozy , Prasata
Národní centrum pro genetické zdroje
Technologie a technika chovu hospodářských zvířat	Hodnocení a tvorba chovného prostředí , Technologie a management chovu přežvýkavců I. , Technologie a management chovu přežvýkavců II.
Výživa a krmení hospodářských zvířat	Predikce nutriční hodnoty krmiv a trávení u přežvýkavců , Výživa vysokoužitkových dojnic